Menaces
Couverture médiatique autour du SPUN et des réseaux fongiques mycorhiziens.
Les champignons mycorhiziens soutiennent la vie sur Terre, mais nous les détruisons à un rythme alarmant. Ce faisant, nous déstabilisons les écosystèmes et perdons l'accès à un vaste système de captage des nutriments qui pourrait contribuer à réformer l'agriculture, la sylviculture et le captage du carbone.

La destruction de l'habitat est la menace #1 pour la diversité fongique mondiale

DESTRUCTION DE L'HABITAT
La perte d'habitat est le principal facteur de perte de biodiversité dans le monde. Sans leurs partenaires végétaux, les champignons mycorhiziens ne peuvent survivre. L'exploitation forestière, l'agriculture et l'urbanisation perturbent radicalement la structure et l'intégrité physique des réseaux fongiques souterrains. Cela nuit à leur capacité à séquestrer le carbone, à déplacer les nutriments et à favoriser l'agrégation du sol.
Lorsque les habitats sont détruits, la structure de la communauté fongique est radicalement modifiée en raison (i) des modifications du microclimat local, (ii) de la perte de partenaires végétaux et (iii) de l'augmentation massive de l'érosion des sols. Les dégâts peuvent prendre des décennies à se rétablir. La perte de prairies et de forêts est particulièrement préoccupante. Les prairies contiennent de 20 à 30 % du carbone du sol mondial, en grande partie grâce à des milliers de milliards de kilomètres de réseaux fongiques qui attirent activement le carbone dans les couches profondes du sol situées sous les racines des graminées. Mais la dégradation des prairies est généralisée et s'accélère. Les réseaux sous-forestiers sont également en train de disparaître : l'exploitation forestière est associée à une diminution massive de la diversité fongique, dont le rétablissement peut prendre plus de 50 ans.
SOURCES
Ammitzl, H. et coll. « La diversité et l'abondance des communautés microbiennes du sol diminuent, et la composition des communautés change en fonction de la gravité des feux qui suivent l'exploitation forestière. » Mol. École 30, 2434—2448 (2021)
Bardgett, R.D. et al. « Lutter contre la dégradation des prairies dans le monde ». Nat. Rev. Earth Environ 2, 720-735 (2021)
Chen, J. « L'exploitation forestière historique modifie la composition et le réseau des communautés fongiques du sol dans une forêt tropicale humide. » Pour. Écol. Gérez 433, 228-329 (2019)
Hartmann, M. et al. « Impact significatif et persistant de la récolte du bois sur les communautés microbiennes du sol dans les forêts de conifères du Nord. » NUMÉRO 6, 2199—2218 (2012)
Lughadha, E.N. et al. « Risque d'extinction et menaces pour les plantes et les champignons. » Plantes, personnes, planète 2, 389-408 (2020)
Song, P. et al. « Effets de l'exploitation forestière historique sur les communautés microbiennes du sol dans une forêt subtropicale du sud de la Chine. » Sol végétal 397, 115-126 (2015)
Sterkenburg, E. et al. « L'importance des arbres de rétention pour la survie des champignons ectomycorhiziens dans les forêts de pins sylvestres coupées à blanc. » J. Appl. Écol. 56, 1367-1378 (2019).
EXPANSION AGRICOLE
Presque toutes les cultures dépendent des champignons mycorhiziens. Pourtant, l'agriculture industrielle a recours à un travail du sol agressif et à de grandes quantités d'engrais chimiques, de fongicides et de pesticides qui détruisent les réseaux fongiques. Sans leurs partenaires fongiques, les cultures ont besoin de plus d'intrants chimiques et sont plus vulnérables à la sécheresse, à l'érosion des sols, aux ravageurs et aux agents pathogènes.
L'agriculture industrielle repose sur le travail du sol et sur d'énormes apports d'engrais, de pesticides et de fongicides, ce qui réduit l'abondance, l'efficacité et la diversité des réseaux fongiques mycorhiziens. Une étude récente a révélé que l'abondance des réseaux fongiques était plus élevée dans les champs gérés biologiquement, et que les communautés fongiques étaient également beaucoup plus complexes : vingt-sept espèces de champignons ont été identifiées comme étant étroitement liées, ou « espèces clés », contre aucune dans les champs gérés de manière conventionnelle. Un travail du sol fréquent et agressif perturbe les communautés fongiques, entraînant une diminution significative de la biomasse et de la diversité par rapport aux systèmes sans labour. L'application de fongicides altère davantage les réseaux fongiques, réduisant de plus de 40 % l'absorption du phosphore dans les terres cultivées. Les effets négatifs des pratiques agricoles s'étendent bien au-delà des champs des agriculteurs. Une vaste étude publiée en 2018 a suggéré que la « détérioration alarmante » de la santé des arbres en Europe était causée par une perturbation de leurs relations mycorhiziennes, provoquée par la pollution à l'azote.
SOURCES
Banerjee, S. et al. « L'intensification de l'agriculture réduit la complexité des réseaux microbiens et l'abondance de taxons clés dans les racines. » NUMÉRO 13 (7), 1722-1736 (2019)
Edlinger, A. et al. « La gestion agricole et l'utilisation de pesticides réduisent la capacité d'absorption du phosphore par les symbiotes végétaux bénéfiques. » PRÉIMPRESSION (version 1) disponible sur Research Square (2021)
van der Linde, S. et al. « L'environnement et l'hôte comme moyens de lutte à grande échelle contre les champignons ectomycorhiziens. » La nature 558, 243-248 (2018)
Wang, Q. et coll. « L'impact du système de culture, du travail du sol et de la saison sur la formation de la communauté fongique du sol dans le cadre d'un essai sur le terrain à long terme. » euros. J. Soil Biol. 102, 1164-5563 (2021)
~ 40 %
de la surface terrestre de la Terre est utilisée pour l'agriculture

Les incendies réduisent la biomasse fongique jusqu'à 96 %

DÉRÈGLEMENT CLIMATIQUE
Les températures extrêmes, la sécheresse et les inondations menacent la capacité des champignons mycorhiziens mondiaux à déplacer les nutriments et à stocker le carbone. Les perturbations liées à la dégradation du climat, comme les feux de forêt intenses, détruisent les plantes et les champignons mycorhiziens souterrains.
Les feux de forêt et autres phénomènes météorologiques extrêmes sont de plus en plus intenses et fréquents. Les incendies graves sont particulièrement destructeurs pour les organismes du sol tels que les champignons. Après un incendie, il faut parfois plus d'une décennie pour que les microorganismes du sol atteignent leur niveau d'avant le feu. Les réseaux fongiques sont plus vulnérables aux feux de forêt que les autres biotes du sol et leur diversité diminue considérablement. Ces changements dans la composition des communautés fongiques peuvent modifier la structure des communautés végétales et avoir des effets en cascade sur tous les niveaux trophiques, diminuant la richesse des organismes qui se nourrissent de champignons, tels que les arthropodes, dans les forêts et les prairies. Les réseaux mycorhiziens dans les forêts prennent encore plus d'importance lorsque les températures augmentent en raison de leur capacité à fournir de l'eau aux plantes hôtes. Les champignons mycorhiziens peuvent aider les plantes à résister à une sécheresse extrême.
SOURCES
Bowd, E.J. et al. « Impacts à long terme des feux de forêt et de l'exploitation forestière sur les sols forestiers. » Nat. Géosci. 12, 113-118 (2019)
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Pressler, Y. et coll. « Réactions des communautés souterraines au feu : une méta-analyse révèle des réponses contrastées des microorganismes du sol et de la mésofaune. » Oikos 128, 309 à 327 (2019)