Les réseaux mycorhiziens constituent un important puits de carbone mondial : les écosystèmes contenant des plantes qui fournissent du carbone aux réseaux souterrains stockent environ 8 fois plus de carbone que les écosystèmes à végétation non mycorhizienne. Les réseaux fongiques souterrains séquestrent le carbone de trois manières. Tout d'abord, les champignons utilisent le carbone pour créer des réseaux en expansion rapide dans le sol. Ces réseaux sont connectés aux racines des plantes et agissent comme des autoroutes nutritives. Deuxièmement, le carbone séquestré est utilisé pour créer des exsudats fongiques. Les exsudats sont des composés organiques résistants qui aident à former des agrégats de sol plus solides, qui agissent comme un réservoir de carbone stable, réduisent les taux d'érosion et maintiennent la structure du sol. Troisièmement, le carbone séquestré est stocké dans la nécromasse fongique. La nécromasse décrit des réseaux souterrains qui ne sont plus actifs, mais dont l'architecture complexe est structurellement intégrée à la matrice du sol. La nécromasse microbienne est responsable de près de la moitié de la matière organique totale du sol et contribue à la stabilisation des sols.

Les champignons sont des butineurs experts. Ils peuvent acquérir des nutriments tels que le phosphore et l'azote du sol, et les échanger avec leurs partenaires végétaux contre des composés carbonés contenant de l'énergie, tels que les sucres et les graisses. L'agriculture industrielle moderne ajoute de grandes quantités d'engrais chimiques qui interrompent la dynamique des échanges entre les plantes et les champignons. Les engrais phosphorés sont extraits sous forme de phosphate naturel : une ressource non renouvelable qui met des millions d'années à se former. D'ici 2040-2050, la demande de phosphore devrait dépasser l'offre, avec des conséquences désastreuses pour la production alimentaire. À mesure que le phosphate naturel se raréfie, l'importance de réseaux fongiques performants pour les systèmes agricoles augmentera. Des réseaux sains réduisent de 50 % la quantité de nutriments lessivés du sol par les pluies et peuvent augmenter la densité nutritionnelle des cultures. L'optimisation de la santé et du fonctionnement des réseaux fongiques peut contribuer à réduire l'empreinte croissante de la production alimentaire mondiale.

Les réseaux fongiques sont des ingénieurs des écosystèmes qui aident à protéger les plantes contre un large éventail de stress. En protégeant les plantes, les réseaux fongiques contribuent à accroître la biodiversité végétale et la résilience des écosystèmes. Les réseaux fongiques aident à prévenir les maladies chez les plantes et renforcent la capacité des plantes à combattre les attaques d'insectes nuisibles en stimulant la production de produits chimiques défensifs. Les réseaux sont également capables de se lier aux métaux lourds contenus dans leur mycélium, protégeant ainsi les plantes de la toxicité, et peuvent rendre les plantes moins sensibles à la sécheresse et au stress salin. Les réseaux fongiques soutiennent également des écosystèmes entiers en excrétant des biopolymères semblables au ciment qui contribuent à réduire l'érosion. Cela contribue à accroître la biodiversité, à maintenir les cycles biogéochimiques et la productivité des écosystèmes.