Le SPUN travaille avec des chercheurs locaux pour développer des campagnes d'échantillonnage qui aident à caractériser la biodiversité mycorhizienne dans divers écosystèmes souterrains. Pour ce faire, nous combinons des données de séquençage de l'ADN mycorhizien géolocalisées avec des variables écologiques afin de générer des prédictions spatiales de la diversité mycorhizienne grâce à une approche d'apprentissage automatique. Cette approche nous permet de prédire les valeurs de la diversité mycorhizienne dans les divers écosystèmes et régions du globe. Ensuite, nous quantifierons l'incertitude de ces prévisions modélisées et identifierons des écorégions sous-échantillonnées afin d'orienter les futures recherches sur les mycorhizes. Afin d'améliorer la précision de nos modèles, nous vérifions nos prévisions en collaborant avec des chercheurs locaux pour échantillonner physiquement le sol des écosystèmes présentant les valeurs d'incertitude les plus élevées, telles qu'identifiées par nos modèles, puis les tester par rapport à nos prévisions. À chaque nouvelle série d'échantillons, nos modèles deviennent plus précis et nos valeurs d'incertitude diminuent.

Sur le terrain, la SPUN travaille avec des scientifiques et des institutions locaux pour identifier les sites d'échantillonnage à partir desquels les échantillons de sol seront prélevés. Les échantillons de sol sont collectés selon un protocole standardisé qui garantit la cohérence de nos analyses. Vous pouvez en savoir plus sur nos protocoles d'échantillonnage ici. Ces échantillons sont ensuite traités dans un laboratoire, où l'ADN est extrait des échantillons de sol, suivi d'une amplification spécifique de l'ADN fongique arbusculaire et ectomycorhizien. La région amplifiée de l'ADN mycorhizien est ensuite envoyée à un laboratoire de séquençage pour l'identification des espèces et des lignées mycorhiziennes exactes de l'échantillon. Ces données sont réintégrées à nos modèles, ce qui améliore nos prévisions. Notre objectif est de générer des données utiles aux gouvernements, aux décideurs politiques, aux ONG et à d'autres acteurs pour aider à diversifier les programmes de conservation.

Pour en savoir plus sur nos expéditions, consultez les récits ci-dessous.