protocole d'échantillonnage

procédure

1. Naviguez jusqu'au site d'échantillonnage et placez deux transects à angle droit pour délimiter une zone d'échantillonnage de 900 m2 (30 m x 30 m). 9 sous-échantillons (5 cm de diamètre sur 10 cm de profondeur) seront collectés. Veuillez consulter la figure pour le schéma d'échantillonnage global. Au total, vous aurez à combiner 9 échantillons provenant de la même parcelle dans le sac en plastique. La grille peut être redimensionnée pour les études portant sur des sites plus petits qui ne peuvent pas tenir dans une grille de 30 m x 30 m, bien que la taille préférée soit de 30 m x 30 m.
2. Remplissez la feuille de métadonnées.
   R. Notez le pays d'échantillonnage, le nom du chef de l'expédition et les collaborateurs.
   B. Classifier l'utilisation du sol du site (par exemple, petite ferme, non agricole, urbaine, incendiée).
   C. Enregistrez les coordonnées GPS (WGS1984) à l'aide d'un appareil GPS et idéalement au format décimal (par exemple -39,5818, -71,51917).
   D. Estimez approximativement le nombre d'espèces végétales présentes et le pourcentage de couverture des arbres par rapport à l'herbe et aux plantes plus petites. Il est important de documenter les plantes ectomycorhiziennes et les plantes mycorhiziennes éricoïdes (Ericaceae). Si les noms des plantes sont connus, notez-les.
   E : Notes finales : notez tout autre élément important qui n'est pas répertorié ci-dessus.
3. Mets des gants. Retirez la couche de litière (matériau meuble) du point central.
4. Au premier point central, enregistrez l'altitude et les coordonnées GPS à l'aide d'un appareil GPS.
5. Prélever le premier échantillon à partir de ce point central (5 cm de diamètre à 10 cm de profondeur) à l'aide de la carotteuse et placer la terre dans le grand sac en plastique. Retirez les grosses racines et les cailloux à la main (ou à l'aide d'un tamis, si vous préférez). Inscrivez le nom du lieu d'échantillonnage, les coordonnées GPS, la date et le nom du collecteur sur le marqueur de chaque sac. Prenez une photo de chaque sac.
6. Dans chaque direction cardinale à partir du point central, mesurez 15 m et prélevez les échantillons restants après avoir retiré la litière en vrac. Complétez ensuite un carré complet pour collecter les 8 échantillons restants (voir figure). Il devrait y avoir 9 sous-échantillons au total.
7. Frottez l'extérieur du sac avec vos mains, mélangez les échantillons soigneusement mais doucement pour que le sol devienne un mélange homogène. Le mélange doit être effectué pendant au moins 2 minutes pour garantir une homogénéisation suffisante.
8. Traitez les échantillons de sol en fonction des conditions du terrain (humide ou sec) :
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   Pour sols secs: Prélever un sous-échantillon de 10 à 20 grammes dans le plus petit sachet (ou tube) et ajouter un sachet de thé propre contenant 10 à 20 g de gel de silice dans le sac/tube de terre. Si vous préférez, conservez les échantillons au réfrigérateur avec de la glace ou des compresses froides dans une glacière. Si vous effectuez un voyage de collecte de plusieurs jours et que vous n'avez pas accès à la réfrigération, vous pouvez sécher les échantillons à l'air libre ou continuer à remplacer le gel de silice si nécessaire. Ne congelez pas les échantillons sur le terrain car nous voulons éviter les effets du gel et du dégel à plusieurs reprises pendant le transport.
   
   ‍Pour sols humides: Prélever un sous-échantillon de 10 à 20 grammes dans le plus petit sac (ou tube), conserver sur le terrain avec de la glace ou des compresses froides. Réfrigérez en fin de journée (si possible) jusqu'à ce que vous atteigniez le lieu de stockage final. Ne congelez pas les échantillons sur le terrain car nous voulons éviter les effets de la congélation et de la décongélation à de multiples reprises. Si la réfrigération n'est pas possible, utilisez le même protocole que celui suggéré pour les sols secs.
9. Accédez à votre prochain site d'échantillonnage et répétez les étapes 1 et 2. Au nouvel emplacement, confirmez que vous êtes à au moins 1,2 km (distance suggérée) de votre lieu d'échantillonnage précédent. Vérifiez cela à l'aide de votre appareil GPS.
10. Effectuez un « lavage du sol » au cœur du sol pour retirer la terre de l'emplacement précédent. Pour ce faire, vous devez prélever une carotte de sol dans la zone d'échantillonnage et la jeter au sol.
11. Répétez l'opération jusqu'à ce que tous les sites aient été collectés.
12. Dès que possible, les échantillons doivent être déplacés à -20 ºC ou -80 ºC pour être conservés jusqu'à ce que l'ADN puisse être extrait.