La verificación básica es el proceso de obtener, mediante medición directa, datos sobre una situación determinada, es decir, las poblaciones microbianas del suelo. Se utiliza para comprobar la precisión de los modelos y las predicciones comparándolos con condiciones observables reales. SPUN utiliza algoritmos para generar puntos críticos de biodiversidad predictivos y verificaciones básicas para comprobar si los modelos son precisos.