Mise à jour sur le terrain du SPUN : connaissances fongiques indigènes + Corse et plus

Notes de terrain

Programme Underground Explorers

En septembre, nous avons ajouté 33 nouveaux bénéficiaires à notre programme Underground Explorers, portant le total des subventions accordées à 55. Cette dernière cohorte comprend des chercheurs de régions sous-explorées de la planète, notamment l'Alaska, l'Indonésie, Madagascar et le Brésil. Vous pouvez en savoir plus sur leurs projets ici.
Un nouvel appel à candidatures sera lancé en février 2024.

Don Tali

À l'occasion de la Journée des peuples autochtones, nous avons sorti un court métrage de Mateo Barrenengoa en collaboration avec Fondation Fungi à propos de Don Talí, l'un des anciens mapuche qui a influencé notre travail au Chili. Don Talí vit dans la région de l'Araucanie, où sa famille cultive des champignons depuis des générations.

Tu peux le regarder ici.

Corse

En septembre, SPUN a échantillonné en Corse, la « montagne dans la mer ». Les forêts de haute altitude de Corse sont considérées comme des laboratoires vivants permettant de déterminer comment les écosystèmes anciens réagiront au changement climatique. L'expédition visait à comprendre comment les plus vieux arbres de la Méditerranée s'associent aux champignons pour survivre aux stress climatiques extrêmes. Nous avons également généré de nouveaux ensembles de données à partir de prairies et d'arbustes à travers l'île.

L'expédition a été dirigée par le Dr Aurélie Deveau, le Dr Francis Martin, le Dr Nicolas Suberbielle, le Dr Jean-Paul Maurice, le Dr Toby Kiers et le Dr Merlin Sheldrake en collaboration avec INRAE et Conservatoire botanique national de Corse. Nos recherches sur le terrain ont permis de mettre au point une technique émergente appelée métatranscriptomique, qui utilise les informations codées dans l'ARN fongique pour comprendre la fonction et l'activité des gènes fongiques souterrains à des moments précis.

Pour en savoir plus sur cette expédition, consultez l'article sur l'Atlantique ci-dessous.

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Projet conjoint de l'Institut du génome

Nous sommes ravis d'annoncer un nouveau projet, dirigé par le Dr Adriana Corrales et le Dr Bethan Manley, en collaboration avec le Dr Francis Martin de l'INRAE et le Dr Camilo Andres Salazar Clavijo de l'Universidad del Rosario en Colombie pour Institut conjoint du génome.

Les champignons mycorhiziens jouent un rôle crucial dans les fonctions écosystémiques des biomes terrestres. Des ensembles de données génomiques, de métabarcodage et biogéochimiques ont été utilisés pour relier la distribution des espèces fongiques aux fonctions critiques de l'écosystème du sol, telles que le cycle des nutriments. Cependant, ces données ont été largement limitées à l'hémisphère nord. Ce projet vise à comprendre la contribution des champignons ectomycorhiziens (ECM) au cycle des nutriments dans les biomes tropicaux et méditerranéens. Nous prévoyons de générer des données sur le séquençage métatranscriptomique des communautés mycorhiziennes afin d'identifier les principaux processus métaboliques et le séquençage du génome d'espèces mycorhiziennes représentatives de chacun des deux biomes étudiés.

Ces données permettront de mieux comprendre à l'échelle mondiale les écosystèmes dominés par les champignons ECM et le rôle qu'ils jouent dans le cycle des nutriments et le stress climatique.

Désert d'Atacama

En décembre, les membres de l'équipe SPUN, les docteurs Adriana Corrales, César Marín et Daniela Soto-Hernández, mènent ensemble une expédition dans le désert d'Atacama en collaboration avec l'unité environnementale du Conseil des peuples de l'Atacameño. Les champignons du désert sont incroyablement sous-échantillonnés, et l'équipe espère savoir quels champignons soutiennent les « oasis agricoles » de l'Atacameño, cultivées depuis des millénaires.

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SPUN dans l'actualité

Aeon - Quand les algues rencontrent les champignons : l'histoire cachée du partenariat le plus réussi de la vie

Aeon présente notre vidéo explicative « Mycorrhizal Fungi : The Roots of Life on Land » racontée par Merlin Sheldrake, animé par May Kindred-Boothby, produit en collaboration avec Fondation Fungi, et avec la musique de Cosmo Sheldrake.

L'Atlantique : la force invisible qui maintient le carbone dans le sol

« Un chasseur de champignons ne cherche pas tant un objet qu'un système. Il efface une couche de feuilles humides pour trouver les filaments de gossamer qui soutiennent le monde. Ces multitudes de filaments fongiques ressemblant à des cheveux, appelés individuellement hyphes, et collectivement, mycélium, constituent le véritable corps des champignons, qui font circuler les nutriments sur le sol de la forêt. »

The Washington Post - Comment quelques sacs de terre pourraient contribuer à rendre la planète plus résiliente au changement climatique

« La steppe kazakhe, qui s'étend du nord de la mer Caspienne aux montagnes de l'Altaï, est l'une des plus grandes steppes sèches du monde et devrait abriter une grande diversité de champignons mycorhiziens. Mais à mesure que la région devient de plus en plus désertique, bon nombre de ces champignons pourraient disparaître. »

Sur notre radar

Articles que nous lisons

Tendances en phytologie »Contrôle symbiotique de la dominance de la canopée dans les forêts subtropicales et tropicales»
Dans cet article, les auteurs proposent une nouvelle hypothèse basée sur la symbiose pour expliquer la prédominance de la famille des Diptérocarpacées dans les forêts tropicales et subtropicales d'Asie. Cette hypothèse appelée « hypothèse vertueuse d'acquisition de phosphore » (VPA) propose que les champignons ectomycorhiziens pourraient rapidement coloniser les plantules de Diptérocarpacées et fournir du phosphore acquis directement à partir de sources organiques via des enzymes extracellulaires hautement spécialisées tout en produisant des rétroactions positives qui pourraient bénéficier à l'hôte ectomycorhizien par rapport aux espèces végétales mycorhiziennes arbusculaires.

Microbiologie de la nature »Un cadre relationnel pour la recherche sur le microbiome avec les communautés autochtones»
Ce document décrit les pratiques de recherche éthiques visant à inclure les communautés autochtones dans la recherche sur le microbiome humain. Dans cet article, nous avons trouvé de nombreux parallèles avec les travaux mondiaux sur le microbiome du sol (par exemple, les peuples autochtones étaient historiquement absents de la coproduction ou des avantages du savoir, de l'extraction intellectuelle et matérielle). Le cadre relationnel de l'auteur entre les peuples autochtones, les chercheurs et les microbes permet de clarifier les domaines dans lesquels la recherche éthique sur le microbiome peut être améliorée grâce à une plus grande souveraineté de la recherche autochtone.

Nouveau phytologue »GlobalAmFungi : une base de données mondiale sur les occurrences de champignons mycorhiziens arbusculaires provenant d'études de méta-codage à barres par séquençage à haut débit» Les auteurs ont produit une compilation open source de données de séquences d'ADN de codes-barres pour les champignons AM, comprenant près de 8 500 échantillons avec leurs emplacements géographiques et leurs métadonnées associés. Nous sommes ravis de la publication de cette ressource essentielle pour étudier la distribution mondiale des champignons AM.

Prochaines conférences

Symposium sur les champignons d'Afrique tropicale
10-12 janvier 2024, Parakou, Bénin

11e atelier international annuel sur les champignons mycorhiziens comestibles
22-26 avril, Esquel, Chubut, Argentine

Conférence internationale sur les mycorhizes
4-9 août 2024, Manchester, Royaume-Uni

Congrès mycologique international
IMC 11-15 août 2024, Maastricht, Pays-Bas

Travail sur le terrain

Êtes-vous intéressé à participer à des recherches sur les champignons ? De nombreux chercheurs mènent actuellement des projets dans divers domaines de la mycologie environnementale. Découvrez-les sur notre Page des associés.

Si vous êtes un chercheur sur les mycorhizes et que vous souhaitez devenir un associé du SPUN, vous pouvez remplissez ce formulaire pour postuler.

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