🌳 Mise à jour du terrain SPUN : nouveaux explorateurs, Colombie et plus

C'est une autre saison chargée dans le métro. Nous avons ajouté une nouvelle cohorte de 39 bénéficiaires à notre programme Underground Explorers, effectué des échantillonnages dans le désert mongol et entrepris deux expéditions dans les forêts nuageuses de Colombie. Nous nous préparons actuellement à l'échantillonnage en Équateur, en collaboration avec NYU Projet More Than Human Life, Fondation Fungi et le Peuple Kichwa d'origine de Sarayaku.

Notes de terrain

Programme Underground Explorers

Nous avons ajouté notre plus grande cohorte d'explorateurs souterrains à ce jour. Le 18 juillet, nous avons accueilli nos 39 nouveaux bénéficiaires pour leur session de lancement. Cette cohorte comprend des explorateurs de 26 pays différents, dont l'Ouganda, l'Ouzbékistan, le Honduras, le Bhoutan, le Maroc et l'Iran. Vous pouvez consulter les nouveaux Explorers et les emplacements de leurs projets ici.

Semaine du climat de New York et Convention sur la diversité biologique

Du 22 au 29 septembre, nous serons présents Semaine du climat à New York et à la fin du mois d'octobre, nous serons présents CBD COP 16 en tant qu'observateurs officiels. Si vous participez à l'un ou l'autre des événements et que vous souhaitez vous connecter, envoyez un e-mail à hello@spun.earth.

Colombie

En juillet, le SPUN, dirigé par le Dr Adriana Corrales, a entrepris une expédition d'une semaine dans les Andes colombiennes pour visiter les forêts nuageuses de Huila et a prélevé des échantillons parmi des chênes noirs afin d'étudier les champignons mycorhiziens qui leur sont associés. Le chêne noir de Colombie est un arbre endémique figurant sur la liste rouge de l'UICN, et nous voulons déterminer la diversité des champignons mycorhiziens qui lui sont associés et identifier les champignons qui peuvent être essentiels à la survie de l'espèce.

Foto : SPUN/Andrés Pacheco - La Cueva CineSur le terrain, les échantillons ont dû être précipités dans un récipient rempli d'azote liquide à -196 °C afin que l'ARN présent dans le sol ne se dégrade pas sous l'effet de la chaleur de la forêt tropicale. De retour au laboratoire, nous utiliserons la métatranscriptomique et le métabarcodage pour mieux comprendre l'identité et la fonction des champignons qui vivent sous terre. Bien qu'il s'agisse de l'une des régions les plus riches en biodiversité de la planète, à notre connaissance, aucun génome de champignon ectomycorhizien tropical n'a jamais été séquencé.

Foto : SPUN/Andrés Pacheco - La Cueva CineDans la forêt nuageuse, les températures étaient élevées et il y avait des jours de pluies torrentielles et de tempêtes. Nous avons passé de nombreuses heures à parcourir des chemins de terre pour atteindre des chênes noirs dans leurs endroits reculés préférés en haut des montagnes. La dernière journée de dégustation s'est terminée par un trajet en téléphérique à travers les collines verdoyantes qui produisent certains des meilleurs cafés du monde.

Photo : SPUN/Adriana CorralesCette étude est soutenue par le Institut conjoint du génome et est en collaboration avec Fondation Franklinia et Docteur Francis Martin de l'INRAE. Au cours de nos excursions sur le terrain, nous avons noué des contacts avec des producteurs de café locaux ainsi qu'avec des experts locaux travaillant dans le domaine de la conservation. Nous espérons que ces travaux permettront de combler une énorme lacune dans les connaissances mondiales sur le rôle fonctionnel des champignons ectomycorhiziens tropicaux.

Vidéos de cartographie

^Avoir vous êtes-vous déjà demandé comment nous créons nos cartes ? Vous pouvez découvrir comment nous hiérarchisons les sites d'expédition par ordre de priorité, comment nous utilisons l'incertitude pour renforcer nos modèles et comment nous cartographions les menaces qui pèsent sur les champignons sur notre nouveau MPage de mappage.

Recherches et explications

Nous avons lancé une nouvelle section sur notre site Web. Gardez un œil sur notre RPage de recherche pour rester au courant des dernières publications de notre équipe et des nouveaux articles expliquant notre science et notre impact.

SPUN dans l'actualité

Forbes - »Comment les champignons du Cameroun peuvent-ils aider les agriculteurs ?»
L'exploratrice souterraine Astride Carole Djeuani, originaire du Cameroun, étudie comment les champignons pourraient être utilisés comme engrais pour améliorer la production végétale des agriculteurs.

Cosmos - »L'incapacité des partenaires fongiques à se déplacer est source de problèmes pour les arbres»
La migration des arbres vers des climats plus propices peut être limitée par l'absence de passagers essentiels à leur survie. Alors que le climat mondial change en raison de l'augmentation des températures mondiales due aux émissions de carbone anthropiques, de nombreuses plantes et animaux se déplacent vers des habitats plus adaptés à leur croissance et à leur protection. Mais les arbres semblent mettre plus de temps à effectuer ces changements.

Forbes - «Ces scientifiques font une course contre la montre pour trouver des champignons rares au Ghana»
Un groupe international de chercheurs, dont l'explorateur souterrain Jacob Ulzen du Ghana, se lance dans une course contre la montre pour découvrir et préserver des espèces de champignons avant qu'elles ne soient perdues à cause de la montée des eaux. L'agriculture est essentielle à l'économie de Ghana: représentant plus de la moitié de son PIB, 40 % des exportations et comme environ 4 ouvriers agricoles sur 10 sont des femmes, les champignons pourraient jouer un rôle clé pour aider les agriculteurs et atténuer l'insécurité alimentaire.

Sur notre radar

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ICOM12

Nous sommes ravis d'y assister ICOM12 à Manchester ce mois-ci. Si vous êtes là, venez nous dire bonjour sur notre stand et renseignez-vous sur nos t-shirts en édition limitée !

Articles que nous lisons

Par J «Une infrastructure innovante pour accéder à la diversité fongique brésilienne grâce à l'apprentissage en profondeur« - Chaves et al. ont produit une base de données de 12 894 images de 505 espèces distinctes de macrochampignons du Brésil afin de permettre une identification des champignons basée sur l'apprentissage en profondeur. Ils visent à développer une application mobile dans le but de démocratiser les connaissances sur les champignons au Brésil.

Données scientifiques »Projet mondial d'échantillonnage des spores : un ensemble de données mondial normalisé sur l'ADN fongique en suspension dans l'air» -Ovaskainen et al. présentent le Global Spore Sampling Project (GSSP), un vaste ensemble de données open source d'ADN fongique provenant d'échantillons de spores prélevés dans le monde entier. Le GSSP contient des informations sur les distributions spatiales de plus de 27 000 espèces, ce qui en fait une ressource précieuse pour l'étude de la macroécologie fongique.

Nouveau phytologue »Les champignons ectomycorhiziens du sapin de Douglas retiennent le carbone nouvellement assimilé dérivé du hêtre européen voisin» - Audisio et al. ont conçu une expérience pour suivre le partage du C dans un réseau ectomycorhizien commun (ECM). Ils ont découvert que les champignons ECM connectés à différents arbres hôtes partageaient le C entre eux, mais pas avec les arbres récepteurs. Ils montrent également que la quantité de carbone fongique partagée est liée au nombre d'espèces d'ECM partagées entre les arbres hôtes.

Base de données »EUCARYOME : la base de données de référence sur les gènes de l'ARNr pour l'identification de tous les eucaryotes» - Tedersoo et al. ont rassemblé des données de séquences d'ADNr d'eucaryotes provenant d'études d'ADN environnementales et de bases de données existantes. Eucaryome est une base de données complète contenant des séquences des gènes d'ADNr couramment utilisés SSU, LSU et ITS, et est la première base de données à inclure des séquences couvrant ces régions produites par des technologies de séquençage de troisième génération.

Évènements à venir

Conférence internationale sur les mycorhizes (ICOM)
6 au 11 août | Manchester, Royaume-Uni

Semaine du climat de New York
22 au 29 septembre | New York, États-Unis

CBD COP 16
21 octobre - 1er novembre | Cali, Colombie

Travail sur le terrain

Êtes-vous intéressé à participer à des recherches sur les champignons ? De nombreux chercheurs mènent actuellement des projets dans divers domaines de la mycologie environnementale. Découvrez-les sur notre Page des associés.

Si vous êtes un chercheur sur les mycorhizes et que vous souhaitez devenir un associé du SPUN, vous pouvez remplir ce formulaire pour postuler.

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